La mayoría de modelos de Minidisc del mercado,ahora mismo,no tienen ningun problema en reproducir mp3 (estamos hablando siempre de Sony,es casi la única marca que sigue apostando por este formato).El problema es si la máquina es vieja.En este caso,obviamente lo primero que tiene que llevar es una conexión USB.Hace un par de años la principal diferencia entre modelos era si llevaban o no la conexión USB.
No aclaras en tu post si se trata de un Minidisc portatil o un Minidisc en formato platina,ni si se trata de un Minidisc clásico o de un Hi-MD.Si es formato platina,olvídate porque no vas a poder transferir nada,al menos que sea de la serie QS,la gama alta de Sony.Si es un Minidic portátil y no es muy viejo,en principio deberías poder transferir archivos MP3 al disco y reproducirlos sin problemas.Si es un Hi-MD la capacidad de almacenamiento además es bastante superior (los discos son de 1GB).
Cuando conectas el USB Windows lo toma como una unidad más y simplemente con copiar y pegar deberías de poder usarlo.
De todas formas Sony distribuye un software con estos productos,se llama SonicStage,creo que ahora están entregando con los Minidisc la versión 2.1,y con los Hi-MD la versión 3.0,y sirve exactamente para gestionar los archivos,bien sea MP3,WAV o WMA,además del formato de Sony llamado Atrac3.